Poluarea apelor poate avea diferite efecte negative asupra sănătății umane. Consumul de apă contaminată poate duce la îmbolnăviri digestive, hepatice, renale și poate afecta sistemul imunitar. De asemenea, expunerea la substanțe chimice toxice din apă poate cauza probleme respiratorii, de piele și chiar cancer. Poluarea apelor dulci poate afecta, de asemenea, habitatul vieții acvatice și biodiversitatea.