Atunci cand meditam, activitatea creierului se schimba. Aceasta poate fi detectata prin electroencefalografie (EEG), o tehnica care masoara activitatea electrica a creierului. Dupa cum s-a demonstrat prin studii, meditatia poate duce la reducerea stresului, anxietatii si depresiei, precum si la cresterea atentiei si concentrarii. La nivelul creierului, meditatia poate duce la modificari ale densitatii materiei cenusii, imbunatatirea conectivitatii sinaptice si cresterea activitatii unei zone a creierului responsabila de controlul emotiilor si atentiei - cortexul cingulat anterior.