Schimbarea pH-ului poate afecta activitatea enzimelor, deoarece acestea au un pH optim la care funcționează cel mai bine. Dacă pH-ul se îndepărtează prea mult de acest nivel optim, enzimele pot încetini sau chiar opri reacțiile lor specifice. Acest lucru poate fi explicat de faptul că pH-ul influențează structura tridimensională a enzimelor și poate afecta modul în care se potrivesc cu substratul.