Poluarea maritimă poate avea efecte devastatoare asupra ecosistemelor marine. Substanțele chimice și deseurile aduse de nave pot polua apa și afecta plantele și animalele acvatice. Aceasta poate distruge recifurile de corali, poate cauza moartea peștilor și a altor organisme marine și poate perturba sănătatea ecosistemelor în întregul lor.