Principalele cauze ale răspândirii și creșterii rezistenței bacteriilor la antibiotice includ utilizarea excesivă și inadecvată a acestora în medicină umană și veterinară, neconformitatea cu protocoalele de prescriere și administrare a antibioticelor, utilizarea pe scară largă în industria agroalimentară și lipsa dezvoltării de noi antibiotice. De asemenea, transmiterea genetică a mecanismelor rezistenței bacteriene contribuie la răspândirea acesteia.