Poluarea solului poate afecta negativ fertilitatea acestuia. Substanțele chimice toxice, cum ar fi pesticidele și îngrășămintele sintetice, pot acumula în sol și pot ucide sau inhiba microorganismele benefice responsabile de dezintegrarea materiei organice. De asemenea, poluarea solului poate afecta structura acestuia și poate reduce capacitatea de reținere a apei și de furnizare a nutrienților către plante.