Utilizarea intensivă a pesticidelor poate avea consecințe negative asupra mediului. Aceste substanțe chimice pot polua solul și apa subterană, pot afecta biodiversitatea prin omorârea insectelor benefice și pot contamina lanțul alimentar. De asemenea, pot apărea rezistența la pesticide în cazul insectelor și erbicidele pot cauza apariția buruienilor rezistente.