Schimbarile climatice afecteaza ecologe ecosistemelor de apa dulce prin cresterea temperaturilor medii ale apei, schimbarea nivelului si fluxului apei, modificarea cantitatii de nutrienti disponibili si cresterea aterizarii de poluanti. Aceste schimbari pot afecta distributia si densitatea speciilor de plante si animale si pot cauza probleme cu calitatea apei.