Afecțiunile autoimune pot fi tratate prin diferite tratamente, precum imunosupresoare, terapia biologică și terapia cu anticorpi monoclonali. Acestea pot aduce ameliorări, prin reducerea inflamației și a simptomelor, dar pot avea efecte secundare și limitări. De exemplu, imunosupresoarele cresc riscul infecțiilor și cancerului și pot fi ineficiente la unele pacienți, iar terapia cu anticorpi monoclonali este scumpă și poate fi dificilă pentru unii pacienți.