Exploatarea gazelor de sist poate duce la poluarea si degradarea solului, a apei si a aerului. Procesul de fracturare hidraulica utilizat in exploatarea gazelor de sist poate duce la contaminarea apelor subterane si la consumul excesiv de apa. In plus, exploatarea gazelor de sist poate implica si defrisari pentru construirea de drumuri si platforme de foraj, ceea ce duce la pierderi de biodiversitate si la degradarea habitatelor naturale.