Principalele surse de poluare a apei sunt dezvoltarea industriala, agricultura intensiva, activitatile de extractie si prelucrare a materialelor, dar si uzurile casnice. Aceste surse pot emite substante periculoase precum metale grele, pesticide, ingrasaminte, produse petroliere, substante chimice si deseuri radioactive in rauri, lacuri si apele subterane. Poluarea apei poate afecta sanatatea umana prin contaminarea surselor de apa potabila, precum si biodiversitatea prin eliminarea sau afectarea habitatelor animalelor si plantelor acvatice si prin afectarea lanturilor trofice.