Tratamentul pentru endometrioză poate fi administrat pentru a ameliora simptomele şi pentru a preveni complicaţiile ulterioare. Medicamentele hormonale sunt utilizate pentru a reduce durerea şi inflamaţia, precum şi pentru a controla creşterea endometriozei. În cazuri mai severe, intervenţia chirurgicală poate fi necesară pentru îndepărtarea ţesutului afectat sau a chisturilor. Uneori, intervenţia chirurgicală poate fi însotită de terapie hormonală pentru a evita reapariţia endometriozei.