Salinitatea apei poate crește în ecosistemele acvatice din cauza unor factori precum: evaporarea apei, diluarea acesteia cu apă dulce din râuri sau din alte surse, comunitățile de organisme care pot afecta nivelul de sare dintr-un ecosistem, precum și activitățile umane, cum ar fi irigarea culturilor, acțiunile care duc la creșterea poluării apelor, etc.