Deoarece ambele sindroame produc simptome similare la nou-nascuti, cum ar fi deficiente cognitive si malformatii fizice, acestea trebuie diferentiate prin analiza cromozomilor pacientului. Sindromul Down este cauzat de o trisomie a cromozomului 21, in timp ce sindromul Edwards este cauzat de o trisomie a cromozomului 18.