Principalele riscuri ale utilizării medicamentelor anticoagulante sunt hemoragiile interne și externe, care pot fi severe și pot pune viața pacientului în pericol, riscul de accident vascular cerebral, infarct miocardic sau alte afecțiuni cardiace, și riscul reacțiilor alergice sau de altă natură ale organismului la principiile active din medicamentele anticoagulante.