Schimbările climatice determină creșterea frecvenței fenomenelor meteorologice extreme (inundații, secete), ceea ce duce la scăderea calității apei. De exemplu, inundațiile pot duce la spălarea substanțelor poluante din sol în râuri și lacuri, iar secetele pot determina scăderea nivelului apei și intensificarea proceselor de eutrofizare.