Printre cele mai importante bacterii benefice se numără cele din familia Lactobacillus, care ajută la digestie și la creșterea imunității. De asemenea, bacteriile din familia Bifidobacterium reduc inflamațiile și previn afecțiunile intestinale. Alte bacterii benefice includ Streptococcus thermophilus, care ajută la digestia lactozei, și Bacillus coagulans, care susține sistemul imunitar.