Ploaia acidă are efecte negative asupra vegetației, a solului și a lacurilor și râurilor. Aceasta poate distruge culturile agricole, afecta habitatul faunei sălbatice, deteriora clădirile și infrastructura, contribui la acidifierea solului și la scăderea fertilității acestuia și deteriora calitatea apei, ceea ce duce la moartea peștilor și a altor animale acvatice.