Schimbările climatice au un impact semnificativ asupra Bălților Dunării, deoarece aceștia sunt sensibili la fluctuațiile nivelului apei și la temperatura apei. Creșterea temperaturii apei duce la scăderea concentrațiilor de oxigen și la creșterea toxicității, afectând astfel flora și fauna din zonă. În plus, creșterea nivelului apei poate cauza inundații, în timp ce scăderea nivelului apei poate cauza uscăciuni, ambele având un impact major asupra mediului înconjurător și asupra comunităților locale.