Poluarea apelor cu substanțe chimice poate avea un efect distructiv asupra vieții acvatice. Substanțele chimice pot afecta creșterea, dezvoltarea și reproducerea animalelor marine, precum și sănătatea umană. Unele substanțe chimice pot rămâne în mediul acvatic timp de ani de zile și pot fi preluate în lanțul alimentar, ceea ce poate provoca efecte negative pe termen lung asupra faunei marine și a ecosistemului în ansamblu.