Efectele secundare ale radioterapiei pot varia în funcție de zona corpului tratată și de doză. Acestea pot include oboseală, erupții cutanate, arsuri, pierderea părului și probleme digestive. În unele cazuri, poate apărea și un risc mai mare de dezvoltare a altor afecțiuni, cum ar fi cancerul secundar. În general, terapeuții radiologi lucrează pentru a minimiza aceste efecte secundare și pentru a maximiza beneficiile terapiei.