Divergența genetică poate influența evoluția speciilor prin intermediul schimbărilor în adaptarea la mediu, prin selecția naturală a celor mai bine adaptate caractere, prin izolarea geografică sau reproductivă a unor populații, prin schimbarea frecvenței genelor sub influența derivei genetice sau a scurgerii genetice și prin apariția de caracteristici noi prin intermediul mutațiilor. Toate aceste mecanisme pot favoriza diversificarea și evoluția speciilor.