Efectele respirației asistate pe termen lung includ probleme pulmonare, infecții respiratorii, insuficiență renală, probleme cu tractul gastro-intestinal, pierderea funcției cognititve și dificultăți cardiovasculare. De asemenea, pacienții care depind de respirația asistată devin adesea izolați, ceea ce poate duce la probleme de sănătate mentală sau la depresie.