Cele mai mari amenințări pentru ecosistemul marin sunt: creșterea temperaturii globale și a nivelului oceanelor, poluarea cu substanțe chimice, pescuitul ilegal, suprapescuitul și tăierea pădurilor de mangrove. Aceste amenințări au un impact negativ asupra florei și faunei marine, precum și asupra comunităților umane care depind de ecosistemele marine pentru hrană și resurse.