O mare provocare în protecția și conservarea biodiversității este creșterea presiunii asupra habitatelor naturale și fragmentarea acestora datorită dezvoltării urbane și agriculturii intensive. De asemenea, schimbările climatice au un impact major asupra biodiversității, alterând habitate naturale și afectând speciile. Alte amenințări majore pentru biodiversitate includ supraexploatarea de resurse naturale, introducerea speciilor invazive și poluarea mediului.