Principalele amenințări care afectează pădurile din România includ tăierea ilegală de copaci, fragmentarea habitatelor naturale prin dezvoltarea urbană sau agricolă și schimbările climatice. Alte amenințări includ incendiile de pădure, poluarea aerului și apei, invazia de specii invazive și boala și dăunătorii. Aceste amenințări pot avea un impact semnificativ asupra biodiversității speciilor de animale și plante care trăiesc în păduri, precum și asupra calității apei și solului din zonele învecinate.