Utilizarea agrochimicalelor poate avea un impact negativ asupra solului, apei și biodiversității. Aceste substanțe pot polua solul și apa, iar utilizarea lor excesivă poate duce la o scădere a fertilității solului și la moartea unor organisme utile. De asemenea, pot crește rezistența la antibiotice a bacteriilor din sol și pot afecta albinele și alte polenizatoare.